En 1939, date à laquelle paraît Le coup de grâce, roman de la solidarité du destin de trois êtres dans le contexte de la montée du bolchevisme, adapté par Volker Schlöndorff en 1976, elle choisit de s’exiler. Elle quitte la France avec son amie américaine pour s’installer aux Etats-Unis ; elle y passera le reste de sa vie. C’est là qu’elle rédigera Mémoires d’Hadrien, superbe roman-méditation dans lequel elle révèle toutes ses qualités d’érudite, Peu après, elle terminera la rédaction de son autre roman admirable  L’oeuvre au noir qu’elle aura porté toute sa vie et auquel elle donnera un souffle puissant. C’est la « recherche de la vérité sur le mystère de la vie, dans un XVIè siècle humaniste tourmenté, bouillonnant,  par un aventurier de l’esprit  à la fois médecin, philosophe et alchimiste » poursuivi par l’Inquisition pour ses écrits et ses travaux trop en avance sur la science officielle.  Paru en 1968, l’ouvrage, qui est en même temps une évocation passionnante de la Renaissance européenne donna lieu à une adaptation au cinéma par André Delvaux,  dans laquelle Zénon ce héros si singulier est incarné par Gian-Maria Volonte qui y déploie sa présence peu commune, accompagné du magnifique Sami Frey.

Marguerite fut aussi élue à l’Académie Royale de langue et de littérature  françaises en 1970, soit dix ans avant l’Académie Française. Historienne dans l’âme et travailleuse infatigable, elle élabora dès 1974 un travail de mémoire familiale considérable Le Labyrinthe du Monde en s’appuyant sur des archives d’une grande complexité.  C’est une trilogie généalogique racontée comme un roman, dans laquelle elle s’interroge sur ses origines. Dans le deuxième volet Archives du Nord – l’épopée paternelle – elle relate comment son père issu de la Flandre française cousinait avec le grand Rubens par la seconde femme de celui-ci Hélène Fourment, qui lui servit fréquemment de modèle.

L’œuvre de Marguerite est une longue réflexion, liée à un « travail d’historien et à un regard de moraliste porté sur la destinée et le temps humain ». Ajoutons : une saine leçon d’exigence.